Fondation

• Le budget fédéral (Paul Martin) de 1995 met fin à l’Aide au transport des céréales fourragères et le ministre de l’Agriculture et de l’Agro-alimentaire (Ralph Goodhale) consulte l’industrie et les provinces sur la manière d’utiliser les ressources transitoires.
• Au Québec  un groupe de travail est créé dont fait partie l’Union des producteurs agricoles (UPA), l’Association professionnelle des Meuniers (APMQ) et le ministère de l’Agriculture des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec (MAPAQ).
• En février 1996, après maints pourparlers, l’UPA est choisi pour gérer la part provinciale destinée au secteur de la production du Fonds canadien d'adaptation et de développement rural (FCADR). La part de l'enveloppe provinciale réservée à la transformation agroalimentaire sera administrée par les organisations représentant le secteur de la transformation. Le Québec est la seule province où le FCADR sera géré distinctement pour servir les deux types de clientèle.
• En vertu de la Partie III de la Loi sur les compagnies, le Conseil pour le développement de l’agriculture du Québec (CDAQ) obtient ses lettres patentes le 7 mars 1996. Les règlements généraux sont adoptés lors de la première réunion des administrateurs, qui sont : Laurent Pellerin, président, Marcel Chagnon, Gratien D’Amours, Jacques Bouchard, Gilles Martin, Christian Lacasse et Desneiges Pépin.
• Les règlements du Conseil sont ratifiés lors d’une assemblée générale spéciale qui a lieu le 28 mars 1996.

1996-1997

• Le CDAQ distribue 4,2 millions de dollars à 4529 producteurs agricoles, en guise de paiement de compensation dans le cadre du fonds d’Aide au transport des céréales fourragères (ATCF).  Le Conseil nomme un directeur intérimaire, Serge Lebeau.
• Mise en oeuvre du programme Développement de l’agriculture dans les régions touchées par l’abandon de l’ATCF (projets régionaux). Le premier projet régional de ce programme Centre d'abattage et de découpe se verra accordé une contribution de 100 000$ le 11 février 1997.
• Les premiers programmes du Fonds canadien d'adaptation et de développement rural (FCADR) sont lancés :
• Aider les entreprises à s’adapter aux nouvelles exigences environnementales
• Amélioration de la capacité concurrentielle
• Recherche appliquée et innovation technologique.
• Un premier projet du FCADR qui se verra accepté «Élaboration d'une stratégie d'encadrement technique des services conseils en agroenvironnement» recevra une contribution de 23 888$ le 17 février 1997.

1997-1998

• Alain Roy est nommé directeur.
• Lancement du Programme agroenvironnemental (PAE). En signant avec le MAPAQ une Entente pour le financement des clubs-conseils en agroenvironnement (CCAE), le CDAQ met à contribution le FCADR pour soutenir la création de 50 CCAE pouvant accompagner 4 000 producteurs agricoles  dans l’adoption de pratiques agricoles durables. Le PAE prévoit également le développement d’un réseau d’agents en agroenvironnement à travers la filière régionale de l’UPA. La participation financière du PAE permet aussi la réalisation du premier Portrait agroenvironnemental des fermes québécoises et contribue à la création d’un consortium de recherche l’Institut de recherche et de développement en agroenvironnement (IRDA)
• Agriculture et Agroalimentaire Canada confie au CDAQ la gestion du Programme national de conservation du sol et de l’eau (PNCSE) au Québec.

1998-1999

• Renouvellement du FCADR pour la période 1999-2003.
• Richard Petit est nommé directeur général.
• Mise en œuvre des six volets du Programme agroenvironnemental.
• Le CDAQ soutient la mise sur pied d'un institut de recherche qui permettra le développement d'une expertise en agroenvironnement : l’Institut de recherche et de développement en agroenvironnement (IRDA).
• Fin du programme ATCF.

1999-2000

• Odile Comeau est nommée directrice générale. Agriculture et Agroalimentaire Canada confie au CDAQ la gestion de l'Initiative de gestion agroenvironnementale (IGAE).

2000-2001

• Lancement du programme Soutien à l’organisation des services-conseils.
• Renouvellement de l’Entente CDAQ-MAPAQ pour le financement des clubs-conseils en agroenvironnement.
• Gagnant des prix Paysage agricole canadien d’Habitat Faunique Canada pour le concours « Ma ferme : une entreprise durable! », prix Valorisation de l’agriculture 2001 (de AAC) pour le comité de gestion des clubs-conseils en agroenvironnement et Phénix de l’environnement (catégorie éducation sensibilisation) pour l’ensemble des activités des CCAE.

2001-2002

• Lancement du programme Environnement.
• Le Conseil en partenariat avec Novalait, contribue au financement de projets de transfert réalisés dans un réseau de fermes pilotes.
• Le CDAQ participe aux consultations préparatoires du Cadre stratégique pour l’agriculture.
• Début des publications d’une chronique du CDAQ dans La Terre de chez nous.

2002-2003

• Fin du Programme agroenvironnemental.
• Maintien du financement des clubs-conseils en agroenvironnement.

2003-2004

• Lancement du Programme d’atténuation des gaz à effet de serres (PAGES) pour le secteur agricole au Québec.
• Lancement du Programme pour l’avancement du secteur canadien de l’agriculture et de l’agroalimentaire (PASCAA) en avril 2004 pour succéder au FCADR.
• Un partenariat AAC-MAPAQ-UPA est formé pour conclure des ententes pour la gestion de certains programmes du volet Environnement du Cadre stratégique pour l’agriculture (CSA) et pour le financement des clubs-conseils en agroenvironnement.

2004-2005

• Lancement du programme Planification agroenvironnementale à la ferme (PAF). Les clubs-conseils en agroenvironnement réalisent plus de 8 000 Plans d’accompagnement agroenvironnemental (PAA) au cours de cette première année de mise en œuvre du programme.
• Lancement du programme Mesure spéciale d’effarouchement des oies (MSEO).
• Lancement du Programme de couverture végétale du Canada (PCVC).
• Lancement du programme Défi-Solution qui permet la livraison du PASCAA au Québec. Ce programme comporte notamment un volet qui soutien la réalisation de projets visant l'obtention de bénéfices collectifs au niveau national.

2005-2006

• Lancement du Programme d’approvisionnement en eau Canada-Québec (PAECQ).
• Lancement de l'Initiative de biosécurité à la ferme (IBF) pour le secteur de la volaille.

2006-2007

• Lancement de l'Initiative des marchés de biocarburants pour les producteurs (IMBP).
• Lancement du programme Planification agroenvironnementale équivalente (PAEE).
• Fin du Programme d'atténuation des gaz à effet de serres (PAGES).
• Le CDAQ présente son mémoire à la Commission sur l'avenir de l'agriculture et de l'agroalimentaire québécois lors des représentations ayant lieu à Gatineau.

2007-2008

• AAC annonce une année de transition pour les programmes issus du Cadre stratégique pour l'agriculture. Le CDAQ assure la relance des cinq programmes dont il assure la gestion (PAECQ, PCVC, MSEO, PAA et PAEE).
• Le CDAQ lance le concours l'Agriculture en tête qui vise à sensibiliser les étudiants de niveau collégial et universitaire aux enjeux de l'agriculture québécoise. Les étudiants doivent explorer et vulgariser leur recherche une affiche destinée à informer leurs pairs.
• Le CDAQ participe activement à l'évaluation du PASCAA.

2008-2009

• Lancement du Programme canadien d'adaptation agricole (PCAA), en septembre 2009, pour succéder au PASCAA, mieux connu au Québec sous le nom de Défi-Solution.
• Reconduction de la Mesure spéciale d'effarouchement des oies en milieu agricole (MSEO), en remplacement de la MSEO 2003-2009.
• Reconduction des Plans d'accompagnement agroenvironnemental (PAA), en remplacement des PAA 2004-2009.
• Le MAPAQ confie au CDAQ la gestion des appels de propositions de trois sous-volets du programme Prime-Vert:
• Sous-volet 8.4 - Réduction des émissions de gaz à effet de serre
• Sous-volet 10.3 - Projets collectifs de gestion de l'eau par bassin versant en milieu agricole
• Sous-volet 11.1 - Appui à la stratégie phytosanitaire québécoise
• Fin du Programme d'approvisionnement en eau Canada-Québec (PAECQ).
• Fin du Programme de couverture végétale du Canada (PCVC).
• Fin de l'Initiative de biosécurité à la ferme (IBF).
• Fin de l'Initiative des marchés de biocarburants pour les producteurs (IMBP).
• La deuxième et dernière édition du concours l'Agriculture en tête a connu un vif succès. Depuis le début du concours, plus de 1 200 étudiants issus de divers cégeps et universités ont réalisé 877 affiches touchant un enjeu de l'agriculture.